Clannad se desarrolla principalmente en Hikarizaka, una ciudad costera ficticia de Japón marcada por colinas, estaciones bien definidas y una comunidad local unida. La narrativa alterna entre la vida escolar y doméstica —con énfasis en el Liceo de Hikarizaka, tiendas familiares y barrios residenciales— y un plano sobrenatural conocido como el Mundo Ilusorio (mundo alternativo recurrente en la obra).
Hikarizaka se describe como una ciudad de tamaño medio cercana al mar, con estaciones bien marcadas que refuerzan atmósferas distintas (primavera para nuevos comienzos, invierno para pérdidas). La topografía de colinas y los puntos de encuentro comunitarios (plaza, escuela, panadería) realzan la sensación de cercanía entre los habitantes, esencial para el tema central de los lazos humanos.
